Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CENPFP49454 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms