Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PRKCHP24723 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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