Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms