Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PTPRCP08575 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRCP08575 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PTPRCP08575 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRCP08575 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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