Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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