Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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