Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms