Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GTF3C6Q969F1 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GTF3C6Q969F1 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms