Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms