Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SS18Q15532 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SS18Q15532 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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