Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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