Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 IL2RA-202ENST00000379954 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 COL28A1-201ENST00000399429 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RCAN1-210ENST00000487990 2520 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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FOXC1Q12948 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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