Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms