Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTSSP25774 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTSSP25774 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms