Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPREP23469 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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PTPREP23469 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPREP23469 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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