Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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CNTN3Q9P232 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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CNTN3Q9P232 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CNTN3Q9P232 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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CNTN3Q9P232 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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