Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
NEDD1Q8NHV4 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms