Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C4orf17Q53FE4 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms