Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC142Q17RM4 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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