Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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