Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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EFNB3Q15768 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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EFNB3Q15768 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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EFNB3Q15768 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
EFNB3Q15768 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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