Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SIX1Q15475 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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SIX1Q15475 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SIX1Q15475 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SIX1Q15475 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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