Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NFIXQ14938 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms