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| FHL3 | Q13643 | AP005901.5-201 | ENST00000545779 | 1796 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | CACNB4-223 | ENST00000636380 | 1756 nt | TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | ARPP21-204 | ENST00000412048 | 2506 nt | TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | TRIP11-201 | ENST00000267622 | 9996 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | TRPM6-204 | ENST00000449912 | 8244 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | ARPP21-201 | ENST00000187397 | 3433 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | TYW3-201 | ENST00000370867 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | UNC13B-210 | ENST00000636694 | 8012 nt | TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | TRRAP-207 | ENST00000628380 | 12644 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC022031.1-201 | ENST00000585985 | 2593 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RN7SKP187-201 | ENST00000365536 | 330 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC093719.1-202 | ENST00000392735 | 373 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP198-201 | ENST00000410376 | 127 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | SLC25A12-202 | ENST00000422440 | 2979 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC023469.2-201 | ENST00000425983 | 657 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AL590502.1-201 | ENST00000433019 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | USP9YP28-201 | ENST00000435142 | 589 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | LINC01487-201 | ENST00000462531 | 905 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | OCIAD1-AS1-201 | ENST00000513576 | 265 nt | TSL 3 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | LINC00589-202 | ENST00000518623 | 938 nt | TSL 4 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | IGKV2-36-201 | ENST00000519999 | 223 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC008662.1-201 | ENST00000521805 | 674 nt | TSL 3 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AP001267.3-204 | ENST00000528578 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC022509.1-202 | ENST00000537525 | 494 nt | TSL 4 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FHL3 | Q13643 | ZNF283-207 | ENST00000593164 | 1260 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC063977.7-201 | ENST00000594454 | 337 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC008764.2-201 | ENST00000597226 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL589935.1-201 | ENST00000602418 | 488 nt | TSL 4 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC005252.1-201 | ENST00000604518 | 1063 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |