Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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