Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CTDSPL2Q05D32 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms