Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VPREB1P12018 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms