Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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HOXA3O43365 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXA3O43365 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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