Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms