Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NDUFA9Q16795 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NDUFA9Q16795 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms