Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
LAMA3Q16787 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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