Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDK4Q16654 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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