Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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