Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms