Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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CHD4Q14839 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHD4Q14839 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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