Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ALCAMQ13740 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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