Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
EIF4EBP1Q13541 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms