Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SRSF5Q13243 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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