Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms