Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
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