Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SREBF2Q12772 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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