Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CENPFP49454 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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