Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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