Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
HOXD10P28358 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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