Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM200BP0CF97 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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FAM200BP0CF97 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM200BP0CF97 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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