Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COPS7AQ9UBW8 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms