Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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