Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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ANKRD42Q8N9B4 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ANKRD42Q8N9B4 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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