Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms