Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GPR26-201ENST00000284674 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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